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en:services:application_services:high_performance_computing:start [2019/08/02 11:48]
hsommer [Preparing Binaries]
en:services:application_services:high_performance_computing:start [2019/10/10 14:29]
vend [Hardware Overview]
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 ====== High Performance Computing ====== ====== High Performance Computing ======
  
-For using our compute cluster you need a GWDG account. This account is, by default, not activated for the use of the compute resources. To get it activated, please send an informal email to <​hpc@gwdg.de>​+For using our compute cluster you need a full GWDG account, which most of the employees of the University of Göttingen and the Max Planck Institutes already have. This account is, by default, not activated for the use of the compute resources. To get it activated ​or if you are unsure whether you have a full GWDG account, please send an informal email to <​hpc@gwdg.de>​
  
 ===== Access ===== ===== Access =====
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 The following documentation is valid for this list of hardware: The following documentation is valid for this list of hardware:
  
-^ Nodes                        ^ #    ^ CPU                             ^ GPU              ^ Cores  ^ Frequency ​ ^ Memory ​ ^ IB    ^ Queue     ^ Launched ​ ^ +^ Nodes                        ^ #    ^ CPU                             ^ GPU              ^ Cores  ^ Frequency ​ ^ Memory ​ ^ IB    ^ Partition ​    ^ Launched ​ ^ 
-| gwdd[001-168] ​               | 168  | Ivy-Bridge \\ Intel E5-2670 v2  | none             | 2✕10 ​  | 2.5 GHz    | 64 GB   | QDR   ​| ​mpi       | 2013-11 ​  |+| gwdd[001-168] ​               | 168  | Ivy-Bridge \\ Intel E5-2670 v2  | none             | 2✕10 ​  | 2.5 GHz    | 64 GB   | QDR   ​| ​medium ​      | 2013-11 ​  |
 | gwda[023-048] ​               | 25   | Abu-Dhabi \\ AMD Opteron 6378   | none             | 4✕16 ​  | 2.4 GHz    | 256 GB  | QDR   | fat       | 2013-04 ​  | | gwda[023-048] ​               | 25   | Abu-Dhabi \\ AMD Opteron 6378   | none             | 4✕16 ​  | 2.4 GHz    | 256 GB  | QDR   | fat       | 2013-04 ​  |
-| sa[001-032]* ​                | 32   | Haswell \\ Intel E5-2680 v3     | none             | 2✕12 ​  | 2.5 GHz    | 256 GB  | QDR   ​| ​mpi       | 2015-03 ​  | +| sa[001-032]* ​                | 32   | Haswell \\ Intel E5-2680 v3     | none             | 2✕12 ​  | 2.5 GHz    | 256 GB  | QDR   ​| ​sa       | 2015-03 ​  | 
-| em[001-032]*\\ hh[001-040]* ​ | 72   | Haswell \\ Intel E5-2640 v3     | none             | 2✕8    | 2.6 GHz    | 128 GB  | QDR   ​| ​mpi       | 2015-03 ​  |+| em[001-032]*\\ hh[001-040]* ​ | 72   | Haswell \\ Intel E5-2640 v3     | none             | 2✕8    | 2.6 GHz    | 128 GB  | QDR   ​| ​em\\hh ​      | 2015-03 ​  |
 | gwde001 ​                     | 1    | Haswell \\ Intel E7-4809 v3     | none             | 4✕8    | 2.0 GHz    | 2 TB    | QDR   | fat+      | 2016-01 ​  | | gwde001 ​                     | 1    | Haswell \\ Intel E7-4809 v3     | none             | 4✕8    | 2.0 GHz    | 2 TB    | QDR   | fat+      | 2016-01 ​  |
 | dfa[001-015] ​                | 15   | Broadwell \\ Intel E5-2650 v4   | none             | 2✕12 ​  | 2.2 GHz    | 512 GB  | FDR   | fat/​fat+ ​ | 2016-08 ​  | | dfa[001-015] ​                | 15   | Broadwell \\ Intel E5-2650 v4   | none             | 2✕12 ​  | 2.2 GHz    | 512 GB  | FDR   | fat/​fat+ ​ | 2016-08 ​  |
-| dmp[011-076] ​                | 76   | Broadwell \\ Intel E5-2650 v4   | none             | 2✕12 ​  | 2.2 GHz    | 128 GB  | FDR   ​| ​mpi       | 2016-08 ​  |+| dmp[011-076] ​                | 76   | Broadwell \\ Intel E5-2650 v4   | none             | 2✕12 ​  | 2.2 GHz    | 128 GB  | FDR   ​| ​medium ​      | 2016-08 ​  |
 | dsu[001-005] ​                | 5    | Haswell \\ Intel E5-4620 v3     | none             | 4✕10 ​  | 2.0 GHz    | 1.5 TB  | FDR   | fat+      | 2016-08 ​  | | dsu[001-005] ​                | 5    | Haswell \\ Intel E5-4620 v3     | none             | 4✕10 ​  | 2.0 GHz    | 1.5 TB  | FDR   | fat+      | 2016-08 ​  |
-| gwdo[161-180]* ​              | 20   | Ivy-Bridge \\ Intel E3-1270 v2  | NVidia GTX 770   | 1✕4    | 3.5 GHz    | 16 GB   | none  | gpu       | 2014-01 ​  |+| gwdo[161-180]* ​              | 20   | Ivy-Bridge \\ Intel E3-1270 v2  | NVidia GTX 770   | 1✕4    | 3.5 GHz    | 16 GB   | none  | gpu-hub       | 2014-01 ​  |
 | dge[001-007] ​                | 7    | Broadwell \\ Intel E5-2650 v4   | NVidia GTX 1080  | 2✕12 ​  | 2.2 GHz    | 128 GB  | FDR   | gpu       | 2016-08 ​  | | dge[001-007] ​                | 7    | Broadwell \\ Intel E5-2650 v4   | NVidia GTX 1080  | 2✕12 ​  | 2.2 GHz    | 128 GB  | FDR   | gpu       | 2016-08 ​  |
 | dge[008-015] ​                | 8    | Broadwell \\ Intel E5-2650 v4   | NVidia GTX 980   | 2✕12 ​  | 2.2 GHz    | 128 GB  | FDR   | gpu       | 2016-08 ​  | | dge[008-015] ​                | 8    | Broadwell \\ Intel E5-2650 v4   | NVidia GTX 980   | 2✕12 ​  | 2.2 GHz    | 128 GB  | FDR   | gpu       | 2016-08 ​  |
-| dge[016-045]* ​               | 30   | Broadwell \\ Intel E5-2630 v4   | NVidia GTX 1070  | 2✕10 ​  | 2.2 GHz    | 64 GB   | none  | gpu       | 2017-06 ​  |+| dge[016-045]* ​               | 30   | Broadwell \\ Intel E5-2630 v4   | NVidia GTX 1070  | 2✕10 ​  | 2.2 GHz    | 64 GB   | none  | gpu-hub       | 2017-06 ​  |
 | dte[001-010] ​                | 10   | Broadwell \\ Intel E5-2650 v4   | NVidia K40       | 2✕12 ​  | 2.2 GHz    | 128 GB  | FDR   | gpu       | 2016-08 ​  | | dte[001-010] ​                | 10   | Broadwell \\ Intel E5-2650 v4   | NVidia K40       | 2✕12 ​  | 2.2 GHz    | 128 GB  | FDR   | gpu       | 2016-08 ​  |
  
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   * [[Running Jobs Slurm]]   * [[Running Jobs Slurm]]
  
-old: 
  
-  * [[Running Jobs]] 
-  * [[Running Jobs (for experienced users)]] 
  
 ===== Latest nodes ===== ===== Latest nodes =====
-Old (now part of [[Running Jobs Slurm]]): + part of [[Running Jobs Slurm]]
- +
-You can find all important information about the newest nodes [[en:​services:​application_services:​high_performance_computing:​new_nodes|here]]+
  
 =====  Applications ​ ===== =====  Applications ​ =====
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   * [[Gaussian09]]   * [[Gaussian09]]
   * [[IPython Parallel]]   * [[IPython Parallel]]
-  * [[Jupyter]] 
   * [[Molpro]]   * [[Molpro]]
   * [[Orca]]   * [[Orca]]
Line 71: Line 65:
   * [[Turbomole]]   * [[Turbomole]]
   * [[Singularity]]   * [[Singularity]]
 +  * [[Spark]]
  
 =====  User provided application documentation ​ ===== =====  User provided application documentation ​ =====
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 =====  Downloads ​ ===== =====  Downloads ​ =====
  
-[[https://​info.gwdg.de/​docs/​lib/​exe/​fetch.php?​media=en:​services:​application_services:​high_performance_computing:​parallelkurs.pdf|Using the GWDG Scientific Compute Cluster - An Introduction]]+[[https://​info.gwdg.de/​docs/​lib/​exe/​fetch.php?​media=en:​services:​application_services:​high_performance_computing:​hpc-course-2019-10.pdf|Using the GWDG Scientific Compute Cluster - An Introduction]]
  
 {{:​en:​services:​scientific_compute_cluster:​script.sh.gz|}} {{:​en:​services:​scientific_compute_cluster:​script.sh.gz|}}